Wikisage is op 1 na de grootste internet-encyclopedie in het Nederlands. Iedereen kan de hier verzamelde kennis gratis gebruiken, zonder storende advertenties. De Koninklijke Bibliotheek van Nederland heeft Wikisage in 2018 aangemerkt als digitaal erfgoed.
- Wilt u meehelpen om Wikisage te laten groeien? Maak dan een account aan. U bent van harte welkom. Zie: Portaal:Gebruikers.
- Bent u blij met Wikisage, of wilt u juist meer? Dan stellen we een bescheiden donatie om de kosten te bestrijden zeer op prijs. Zie: Portaal:Donaties.
DARPin
DARPins, acroniem van de Engelse benaming: Designed Ankyrin Repeat Proteins, zijn kunstmatige eiwitten die antigenen kunnen herkennen en binden. Structureel zijn ze afgeleid van ankyrin-eiwitten en bestaan ze uit verschillende herhaalde motieven van deze eiwitten. DARPins met in totaal vier herhaalde motieven en een moleculaire massa van ongeveer 14 nDa zijn ongeveer 10 keer lichter dan een IgG-type antilichaam.Hun affiniteit voor een antigeen is vergelijkbaar met die van een antilichaam.DARPins kunnen zich gedragen als Agonist, Antagonist, inverse agonisten of enzymremmers.[1] DARPins werden aanzienlijk ontwikkeld aan de Universiteit van Zürich. Het is bedoeld om te worden gebruikt als hulpmiddelen voor onderzoek, evenals diagnostiek en therapeutica.[2]
Structuur
DARPins zijn structureel afgeleid van eiwitten die een of meer zogenaamde ankyrin-herhaalmotieven dragen. Dit wijdverbreide, meestal 33 Aminozuur-lange motief, bestaat uit een β-lus en twee α-Helices en kan niet alleen worden gevonden in het cytoskelet-eiwit ankyrin, maar in grote aantallen in eiwitten van bijna alle levende wezens.[3][4]DARPins dragen minstens drie van deze motieven. Zelfs kleinere kunstmatige herhaalde eiwitten met slechts één of twee herhaalde motieven vormen geen voldoende tertiaire structuur.[5] In het bijzonder worden DARPins met twee of drie variabele herhalingsmotieven geflankeerd door twee constante herhalingsmotieven ontwikkeld en gebruikt als antilichaam nabootsen.
Features
Net als andere mimetica van antilichamen hebben DARPins een hogere temperatuurstabiliteit dan de meeste antilichamen. Een denaturatie van DARPins met vier tot zes herhaalde motieven vindt alleen plaats bij temperaturen boven het bereik van 66 tot 85 ° C.[6] DARPins, die met behulp van genetische manipulatiemethoden in doelcellen worden geïntroduceerd, zijn geschikt als alternatief voor intrabodies en RNAi voor het onderzoeken van celfuncties en vertegenwoordigen een optie in gentherapie.
Moleculebibliotheken van DARPins worden gecreëerd met behulp van moleculair biologische methoden en willekeurige mutagenese.Na selectie van de meest geschikte DARPin, kan het met behulp van productieorganismen zoals Escherichia colimet een zeer hoge opbrengst worden geproduceerd.[6]
Literatuur
- Forrer P, Binz HK, Stumpp MT, Plückthun A (February 2004). Consensus design of repeat proteins. ChemBioChem 5 (2): 183–9 . PMID: 14760739. DOI: 10.1002/cbic.200300762.
- Stumpp MT, Amstutz P (March 2007). DARPins: a true alternative to antibodies. Curr Opin Drug Discov Devel 10 (2): 153–9 . PMID: 17436550.
- Stumpp MT, Binz HK, Amstutz P (August 2008). DARPins: a new generation of protein therapeutics. Drug Discov. Today 13 (15-16): 695–701 . PMID: 18621567. DOI: 10.1016/j.drudis.2008.04.013.
Referenties
- º Stumpp MT, Binz HK, Amstutz P (August 2008). DARPins: a new generation of protein therapeutics. Drug Discov Today 13 (15-16): 695–701 . PMID: 18621567. DOI: 10.1016/j.drudis.2008.04.013.
- º Heinzelmann E (2008). Sjabloon:Webarchiv (PDF; 142 kB) Swiss Engineering 12/2008: 62-63.
- º Bork P (December 1993). Hundreds of ankyrin-like repeats in functionally diverse proteins: mobile modules that cross phyla horizontally?. Proteins 17 (4): 363–74 . PMID: 8108379. DOI: 10.1002/prot.340170405.
- º https://www.antibodies-online.com/resources/18/1503/antibody-and-immunoglobulin-alternatives-part-2/#DARPins
- º Mosavi LK, Minor DL, Peng ZY (December 2002). Consensus-derived structural determinants of the ankyrin repeat motif. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99 (25): 16029–34 . PMID: 12461176. PMC: 138559. DOI: 10.1073/pnas.252537899.
- ↑ 6,0 6,1 Binz HK, Stumpp MT, Forrer P, Amstutz P, Plückthun A (September 2003). Designing repeat proteins: well-expressed, soluble and stable proteins from combinatorial libraries of consensus ankyrin repeat proteins. J. Mol. Biol. 332 (2): 489–503 . PMID: 12948497.
